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2025年3-4月-1/5:【台兒知識庫】案例分析:由於 PEX1 致病變異導致的 Zellweger 症候群的臨床和遺傳分析( Case Report: A Clinical and Genetic Analysis of Zellweger Syndrome Due to disease-causing variations of PEX1 )

 3月 27, 2025   

台兒通訊 >> 2025年 >> 3-4月

文/慈濟大學分子生物暨人類遺傳學系 靖永皓助理教授


(圖一)三人組(Trio)全外顯子定序(WES)發現 PEX1 基因致病變異。
嬰兒從父母各遺傳到一個致病變異(Compound Heterozygous):父親攜帶 PEX1 變異(p.Arg798SerfsTer35);母親攜帶 PEX1 變異(p.Lys861Ser fsTer30)。這兩個變異均導致 frameshift(移碼突變),最終產生過早終止密碼(Premature Stop Codon),導致基因產物完全缺失。由於 PEX1 的蛋白產物完全缺失,導致過氧化酶體無法正常發育造成 Zellweger Syndrome 表現型。

摘要

Zellweger 症候群(Zellweger Syndrome, ZS)是一種罕見的體染色體隱性遺傳疾病,屬於 Zellweger 光譜疾病(Zellweger Spectrum Disorders, ZSD),其特徵為過氧化酶體生合成缺陷。本報告呈現一例確診為 Zellweger 症候群的臨床案例,重點描述診斷過程、基因分析及臨床影響。全外顯子定序(Whole-Exome Sequencing, WES)鑑定出 PEX1 基因的複異型合子致病變異:c.2392delC(p.Arg798SerfsTer35)與 c.2582_2583insA(p.Lys861SerfsTer30)。本案例強調早期遺傳診斷及帶因者篩檢在罕見代謝疾病中的重要性。

簡介

Zellweger 症候群(ZS)是 Zellweger 光譜疾病(ZSD)中最嚴重的表現型,其為一類過氧化酶體生合成障礙(Peroxisome Biogenesis Disorders, PBDs)[1] [2],由 PEX 基因的致病變異引起。其中,PEX1 是最常涉及的基因,負責編碼 AAA ATPase,該蛋白在過氧化酶體基質蛋白的進口過程中發揮關鍵作用。ZS 的臨床表現包括低張力(hypotonia)、顱顏異常(craniofacial dysmorphisms)、癲癇發作(seizures)、肝功能障礙(liver dysfunction)及發育遲緩(developmental delay)[3, 4]。本案例研究詳細分析一名經基因檢測確診為 Zellweger 症候群的新生兒。

病例介紹

一對夫妻於 2022 年末懷孕,並於中孕期超音波檢查中發現多種先天異常,包括第四腦室開放(open fourth ventricle)、小腦蚓部發育不全(cerebellar vermis hypoplasia)、胸膜積水(pleural effusion)及腎臟異常(renal abnormalities)。由於異常發現,孕婦隨後至三家醫學中心進行進一步影像學檢查,但結果對疾病嚴重程度仍無明確結論。

該嬰兒於 2023 年 6 月,在 38 週妊娠時出生。出生後表現為低張力(hypotonia)、眼距過寬(wide-set eyes)、肌張力高(high muscle tone)及抽搐(seizure activity)。初步住院觀察後,轉診至第三級醫療中心進行進一步評估。新生兒代謝篩檢(tandem mass spectrometry, MS/MS)顯示異常的過氧化酶體生化標誌物。

遺傳分析

出生後第 5 天,進行了三人組(trio-based)的全外顯子定序(WES),包括父母與患兒。在8 天內獲得 WES 結果,鑑定出 PEX1 基因的複異型合子致病變異(compound heterozygous pathogenic variants):

  • PEX1:NM_000466.3:c.2392delC, p.Arg798SerfsTer35(父系遺傳)
  • PEX1:NM_000466.3:c.2582_2583insA, p.Lys861SerfsTer30(母系遺傳)

這兩個變異均屬於移碼突變(frameshift mutation),導致過早終止密碼(premature stop codon),造成 mRNA 因為無義介導的mRNA降解(Nonsense-mediated decay ,NMD) 最終導致完全無法產生PEX1 蛋白功。根據 ACMG/AMP 變異分類準則 [4],這兩個對偶基因均被評定為『致病性(pathogenic)』。

討論

Zellweger 症候群與嚴重的過氧化酶體生合成缺陷相關,導致多系統受影響。本案例中所鑑定的 PEX1 變異會產生因為移碼突變(frameshift mutation),導致過早終止密碼(premature stop codon),造成 mRNA 因為無義介導的mRNA降解(Nonsense-mediated decay , NMD) 最終導致完全無法產生PEX1 蛋白功。符合 Zellweger 症候群的已知致病機制。由於 Zellweger 症候群屬於體染色體隱性遺傳疾病(autosomal recessive inheritance),因此遺傳諮詢對於未來的生育規劃非常重要。對高風險家族進行帶因者篩檢,可有助於在懷孕前辨識異常攜帶者。

結論

本案例凸顯早期遺傳檢測在 Zellweger 症候群診斷中的關鍵作用。快速的 WES 分析促成早期分子診斷,使臨床團隊得以提供適當的醫療及遺傳諮詢。



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